Zdeněk Hubáček:
Multijet production in D0 experiment
(Školitel: V. Šimák)
Roman Otec:
Diffraction in D0 experiment
(Školitel: V. Šimák)
Ústav částicové a jaderné fyziky, MFF UK v Praze
Martin Spousta:
Jets in heavy ion collisions in ATLAS experiment
(Školitel: J. Dolejší)
David Šálek:
Dijet Production in Diffractive ep scattering
(Školitel: A. Valkárová)
Richard Polifka:
Analysis of dijets events in diffrractice ep scattering in
H1 experiment
(Školitel: A. Valkárová)
Dalibor Nedbal:
Search for the VHE gamma rays with HESS
(Školitel: L. Rob)
Jiří Kvita:
Measurement of Differential Cross-Sections in the ttbar->l+jets Channel at sqrt(s) = 1.96 TeV
with the DO Experiment at Fermilab (duben 2009) (Školitel: R. Leitner)
Karel Černý :
Tests of QCD hard factorization in diffractive photoproduction of dijets at HERA (2008) (Školitel: A. Valkárová)
Marián Kolesár:
Chiral perturbation theory and the low energy phenomenology of pseudoscalar mesons (2008) (Školitel: J. Novotný)
Miroslav Nožička:
Forward Silicon Tracker of the H1 Experiment: Hardware and Software Study of D* Production
(prosinec 2006) (Školitel: J. Žáček)
Ondřej Chvála:
Transverse Phenomena in Pion Production in Hadronic Collisions at SPS Energy (listopad 2006) (Školitel: J. Dolejší)
Michal Malinský:
Nondecoupling Effects of Heavy Higgs Boson in Two Higgs Doublet Extensions of The Standard Model (červenec 2005) (Školitel: J. Hořejší)
Sekce fyziky elementárních částic FZÚ AV ČR, v. v. i.
Jiří Hejbal:
QCD analysis of photon structure function (únor 2010)
(Školitel: J. Chýla. Pracuje ve FZÚ.)
Oldřich Kepka:
QCD and Diffraction in the ATLAS Experiment at the LHC (listopad 2009)
(Školitel: A. Kupčo. Pracuje ve FZÚ.)
Hana Hromčíková:
Modelling of Radiobiological Mechanisms in Cells and Tissues (duben 2009)
(Školitel: M. Lokajíček st. Pracuje ve FZÚ.)
Lukáš Přibyl:
pp interactions in ATLAS experiment (2008)
(Školitel: S. Němeček. Pracuje mimo FZÚ.)
Martina Boháčová:
Pierre Auger Fluorescence Detector Study of The Air Fluorescence (prosinec 2006)
(Školitel: J. Grygar. Pracuje ve FZÚ.)
Michael Prouza:
Ultra-high energy cosmic rays and their detection in Pierre Auger experiment (březen 2006) (Školitel: J. Grygar. Pracuje ve FZÚ.)
Jan Valenta:
Systém čtení dat v polovodičovém detektoru ATLAS a konfigurace trigeru nejvyšší úrovně
(2005)
(Školitel: V. Vrba. V současnosti působí v zahraničí.)
Jan Smolík:
Measurement of pionium lifetime and study of correlation of particles with small relative velocities (srpen 2005) (Školitel: R. Lednický. Pracuje ve FZÚ.)
Dále uvedené doktorské disertační práce byly obhájeny před vznikem současného Centra, v době fungování jeho přímého předchůdce, totiž Centra částicové fyziky LN00A006 (program Výzkumných center MŠMT z let 2000 - 2004). Téměř všichni jejich autoři se přímo podílejí na současném výzkumném programu Centra částicové fyziky, spolupráci v mezinárodních projektech a laboratořích a v neposlední řadě i na výchově další generace mladých fyziků.